Основной перечень типовых работ и оказываемых услуг выполняется в соответствие со списком разработанных методик
- Клонирование, выделение и очистка целевых белковых комплексов
- Конструирование мутантных форм белков с измененной конформационной подвижностью с помощью искусственных дисульфидных связей
- Крупномасштабное выделение (до 100 литров культуры) и очистка целевых белковых комплексов и ассоциированных с ней белков
- Идентификация белков регуляторных субъединиц фосфатазы PP1 методом пептидных карт
- Препаративное аффинное разделение белковых комплексов из ядер клеток линии HeLa и Т-клеток (CEM или Jurkat)
- Расчет трехмерных моделей белковых комплексов основанных на экспериментальных данных полученных методом ЯМР спектроскопии высокого разрешения
- Сравнительный анализ онкоспецифичных белков и сигнальных липидов экзосом, продуцируемых нормальными и онкотрансформированными клетками на основе структурно-протеомных исследований с использованием ЯМР спектроскопии и высокоразрешающей масс спектрометрии
- Выявление сайтов связывания белка с ДНК с использованием кросс линк технологии и высокоразрешающей масс-спектрометрии
- Оценка распределения биологических комплексов по размерам с помощью динамического светорассеяния
- Визуализация внутриклеточных структур методом локализационной микроскопии с разрешением 30-40 нм
- Измерение сил взаимодействия биологических структур на уровне одиночных молекул в диапазоне сил 0.1-200 пН на установке « Лазерный пинцет»
- Исследование влияния различных антибактериальных агентов на процесс бактериальной транскрипции на уровне индивидуальных комплексов РНКП-ДНК с использованием акустической ловушки
- Исследование на одномолекулярном уровне динамики образования и диссоциации ДНК белковых комплексов методом оптической ловушки
- Исследование механических свойств клеточных мембран на установке « Лазерный пинцет»
- Исследование на уровне одной клетки с помощью флюоресцентной микроскопии стохастических процессов, связанных с работой различных систем защиты бактерий от чужеродных нуклеиновых кислот
- Определение следовых количеств различных фармацевтических препаратов в жидкостях человека ( плазма крови, слезы, моча) с использованием имеющегося комплекса хромато-масс-спектрометрических методик
- Проведение крупномасштабного виртуального скрининга библиотек низкомолекулярных соединений для поиска высокоэффективных лигандов белков различной химической природы с использованием высокопроизводительных многопроцессорных суперкомпьютеров
- Конструирование коротких альфа-спиральных пептидов с максимально возможной конформационной стабильностью и биологической активностью (метод SeqOpt)
- Проведение поиска точечных аминокислотных замен для конструирования ферментов с повышенной термостабильностью и каталитической активностью
- Моделирование глобулярных белков и их комплексов с различными лигандами по гомологии с комплексами белков с известной пространственной структурой
Стоимость работ в рублях определяется исходя из времени затраченного на проведение заказанного измерения или оказания услуги.
Себестоимость одного часа работы на оборудовании ЦКП:
№ п/п |
Наименование единицы оборудования |
Себестоимость работы по элементам затрат, руб. в час |
Себестоимость работы на оборудовании, руб. в час |
A |
B |
C |
D |
E |
F |
1 |
ЯМР спектрометр NMR Varian 700 Chemical |
1024.9 | 120 |
60 |
250 |
800 |
2254.9 |
2 |
Масс-спектрометр FT-ICR MS 9.4 T Varian, с ионно-циклотронным резонансом с Фурье преобразованием |
703.43 |
140 |
70 | 450 |
800 |
2163.43 |
3 |
Тандемный хромато-масс-спектрометр LCMS-IT-TOF (Shimadzu) |
353.17 |
35 |
55 |
50 |
450 |
943.17 |
4 |
Комплекс FA1 для исследования динамики нано-био-машин (NanoBio-dynamic) |
2117.68 |
80 |
40 |
120 |
500 |
2857.68 |
5 |
Комплекс оборудования для хранения, пробоподготовки и анализа органических веществ |
196.47 |
85 |
50 |
600 |
900 |
1831.47 |
6 |
Система 5800 MALDI TOF/TOF (AB Sciex) |
435.44 |
90 |
60 |
400 |
800 |
1785.44 |
7 |
Комплекс оборудования для одномолекулярных исследований на базе спектрометра с поверхностно-акустической волной |
155.86 |
45 |
20 |
150 |
300 |
670.86 |
8 |
Фемтосекундная лазерная система RAPOP-100 |
102.5 | 35 | 30 | 50 |
400 |
617.5 |
9 |
Микроскоп медико-биологического Nikon Ti с цифровой камерой |
196.47 |
40 | 30 |
80 |
500 |
846.47 |
Расчет себестоимости одного часа работы на научном оборудовании ЦКП (F) определяется по следующей формуле:
F = А + B + C + D + E, где
А - амортизационные отчисления по научному оборудованию, участвующему в выполнении работ и оказании услуг, руб. в час;
В - затраты на содержание и обслуживание основного и вспомогательного оборудования, участвующего в выполнении работ и оказании услуг, руб. в час (затраты на содержание «чистых комнат», метрологическое обеспечение, сервисный ремонт и техобслуживание оборудования);
С - затраты на коммунальные услуги, в т.ч. на электроэнергию, руб. в час;
D - затраты на расходные материалы, руб. в час;
E – заработная плата оператора оборудования, руб. в час. |